pIndigoBAC536-S (Shi et al. 2011) 是一个高效的BAC载体,广泛应用于动物、植物、藻类和真菌的基因组BAC文库构建。该载体以pIndigoBAC536为基础,在LacZ基因两侧各设计了一个I-SceI位点,I-SceI酶切后的载体骨架具有两个不可自连的粘性末端。I-SceI位点含18个碱基,在基因组中存在的几率极低。例如,在水稻和拟南芥基因组中都没有发现I-SceI位点,在玉米基因组中也仅发现有两个,因此I-SceI位点非常适合外源插入大片段的精确检测,同时也方便完整外源大片段的回收及在BAC和其它载体之间定向互换。
pMSBBAC1载体是在pMSBBACs载体(黄胜等, 2006)的基础上引入了两个I-SceI位点。pMSBBAC1载体除了具有上述pIndigoBAC536-S载体的优点外,还包含有安普拉霉素抗性标记、转移起始位点oriT、φC31整合酶基因int、整合位点attP 等元件,能通过接合转移和原生质体转化的方法导入链霉菌模式菌株,并通过位点特异性重组整合到链霉菌染色体中进行异源表达。